Forschungsthemen

RNA-Moleküle sind nicht nur kurzlebige Träger von Informationen, die für Proteine kodieren, sondern erfüllen auch eine Vielzahl wesentlicher zellulärer Funktionen, die von enzymatischen Aktivitäten über die Bereitstellung großflächiger Gerüste bis hin zu komplizierten riboregulatorischen Mechanismen reichen, welche zelluläre Signale und Homöostase steuern. Trotz ihrer einfachen Zusammensetzung aus nur vier Bausteinen nehmen RNAs, wie auch Proteine, komplexe 3D-Strukturen an, die für ihre zelluläre Funktion unerlässlich sind. Die Funktion einer RNA wird also sowohl durch ihre Sequenz als auch durch ihre Faltung bestimmt.
Unsere Gruppe untersucht, wie die Strukturbildung die Funktion und das Interaktom von mRNAs in menschlichen Zellen, Bakterien und Viren beeinflusst. Wir verwenden Strukturanalysen und massiv parallele Reporterassays in Verbindung mit Next Generation Sequencing, um die RNA-Faltung und ihre funktionellen Konsequenzen zu entschlüsseln. Darüber hinaus nutzen und entwickeln wir Hochdurchsatzmethoden zur Untersuchung der RNA-Bindepräferenzen von Proteinen mit dem Ziel zu verstehen, wie RNA-Protein-Interaktionen zelluläre Entscheidungen beeinflussen. In einer zweiten Forschungsrichtung charakterisieren wir die Wechselwirkungen zwischen RNA und kleinen Molekülen, um zu klären, wie die RNA-Funktion effektiv moduliert werden kann, und um Informationen für Studien zur Entwicklung gegen RNA-gerichtete Medikamente zu erhalten.

mRNA Interaktom

Wir arbeiten an der Identifizierung und Charakterisierung von mRNA-Strukturen, welche die post-transkriptionelle Genregulation durch Interaktion mit Proteinen beeinflussen.

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Virale RNA Strukturen

RNA-Viren nutzen RNA-Strukturen, um ihre Replikation mit der Transkription und Translation viraler mRNAs und Proteine innerhalb ihrer minimalen Genome zu synchronisieren.

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Genexpression im Mitochondrium

Die Gruppe von Benedict Tan untersucht die komplizierte Verknüpfung der Transkription mit der RNA-Prozessierung und der Translation im Kraftwerk der Zelle – dem Mitochondrium.

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Gruppe Frühling 2024

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